בבסיס המחקר של הפקולטה עומדים שורה של מכוני מחקר רב-תחומיים המפעילים היום שורה ארוכה של מחקרים מגוונים. באמצעות פעילות זו מקודמות טכנולוגיות חדשות ומוטמעות בעשייה ההנדסית בארץ ובעולם.
המכון הלאומי לחקר הבנייה הוא המסגרת המחקרית לפיתוח ויישום ידע רב תחומי בסביבה הבנויה בארץ ובעולם. המכון משמש כמוקד של שיתופי פעולה למחקר, בחינה ומימוש רעיונות חדשים ביישום טכנולוגיות מתקדמות בתחום הבנייה.
המכון מופקד על בחינה ואישור של שיטות בנייה חדשות מטעם משרד הבינוי והשיכון. בנוסף, המכון תורם להעשרה וקידום הידע המקצועי, למימוש טכנולוגיות חדישות, וכלים במגוון רחב של נושאים הרלוונטיים לענף הבנייה. המכון פועל לגיבוש אסטרטגיות לפתרון בעיות הנדסיות מורכבות ולגיבוש מדיניות הבנייה של מדינת ישראל. המכון פועל להפצת הידע האקדמי הנרכש בקרב הציבור המקצועי בישראל ובעולם.