המסלול בהנדסת תחבורה נועד להכשיר מהנדסים שעיסוקם יהיה בתחומי התחבורה השונים: תכנון תחבורה, תחבורה ציבורית, הנדסת תעבורה ובטיחות בדרכים, תכן דרכים, תכן מבנה דרכים. תוכנית הלימודים נועדה לספק את הכלים ובסיס המיומנויות הנדרש ממהנדס התחבורה בעולם משתנה של טכנולוגיה שבו קיימת הקפדה על יצירת סביבה בת-קיימא.
ההכשרה המקצועית של מהנדס התחבורה מורכבת מחלק בסיסי של לימודי הנדסה אזרחית, וחלק מתקדם של מקצועות תחבורה, חקר ביצועים ותכנון ערים. במסגרות לימודי הבסיס נלמדים מקצועות מתחום הנדסת המבנים, ניהול הבנייה, חומרי בנייה, הנדסת הסביבה ומשאבי מים. מגוון המקצועות הנלמד במסגרת לימודי התחבורה נועד להקנות מיומנות רב-תחומית, במקצועות המדעים המדויקים, מדעי החברה, תכנון תשתיות, חקר בצועים ותכנון אורבני, הדרושים לתפקוד מהנדס התחבורה. התוכנית מאפשרת לימוד מקצועות בחירה בפקולטה וגם מפקולטות אחרות בטכניון, כגון ארכיטקטורה ותכנון ערים, תעשיה וניהול ועוד.
התוכנית הנה ארבע-שנתית ומקנה את התואר "מוסמך למדעים בהנדסה אזרחית – הנדסת תחבורה".
